Publications and Presentations:


Journal Papers:

·         U. Aydin, Y. Serinagaoglu Dogrusoz, "A Kalman Filter Based Approach to Reduce the Effects of Geometric Errors and the Measurement Noise in the Inverse ECG Problem," Medical & Biological Engineering & Computing, vol. 49, no. 9, pp. 1003-1013, September 2011 (DOI: 10.1007/s11517-011-0757-8).

·         M. Cavusoglu, T. Ciloglu, Y. Serinagaoglu, M. Kamasak, O. Erogul and T. Akcam, “Investigation of Sequential Properties of Snoring Episodes for Obstructive Sleep Apnoea Identification,” Physiol. Meas. vol. 29, no. 8, pp. 879-898, August 2008.

·         M. Cavusoglu, M. Kamasak, O. Erogul, T. Ciloglu, Y. Serinagaoglu and T. Akcam, “An Efficient Method for Snore/Nonsnore Classification of Sleep Sounds,” Physiological Measurement, vol. 28, no. 8, pp. 841-853, August 2007.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks and R.S. MacLeod, “Improved Performance of Bayesian Solutions for Inverse Electrocardiography using Multiple Information Sources,” IEEE Transactions on Biomedical Eng., vol. 53, no. 10, pp. 2024-2034, October 2006.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks and R.S. MacLeod, “Bayesian Solutions and Performance Analysis in Bioelectric Inverse Problems,” IEEE Transactions on Biomedical Eng, vol. 52, no. 6, pp. 1009-1020, June 2005.

·         Y. Serinagaoglu, R.S. MacLeod, B. Yilmaz, and D.H. Brooks, “Multielectrode venous catheter mapping as a high quality constraint for Electrocardiographic inverse solution,” J. of Electrocardiology, vol. 35 (suppl. 1), no. 4, pp. 65-73, Oct. 2002.

 

International Conferences:

·         Alireza Mazloumi Gavgani, Yesim Serinagaoglu Dogrusoz, “Use of Genetic Algorithm for Selection of Regularization Parameters in Multiple Constraint Inverse ECG Problem,” IEEE EMBS conference, Aug. 30 – Sep. 3, 2011, Boston, MA, USA

·         Ersin Karci, Yesim Serinagaoglu Dogrusoz, Tolga Ciloglu, “Detection of Post Apnea Sounds and Apnea Periods from Sleep Sounds,” IEEE EMBS conference, Aug. 30 – Sep. 3, 2011, Boston, MA, USA

·         Sedat Sarikaya, Gerhard-Wilhelm Weber, Yesim Serinagaoglu Dogrusoz, “Combination of Conventional Regularization Methods and Genetic Algorithm for Solving the Inverse Problem of Electrocardiography,” International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, (HIBIT), April 20-22, 2010, Antalya, Turkey

·         Umit Aydin, Yesim Serinagaoglu, “Comparison of Bayesian MAP Estimation and Kalman Filter Methods in the Solution of Spatio-Temporal Inverse ECG Problem,” World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, September 7 - 12, 2009, Munich, Germany, IFMBE Proceedings, vol. 25/2, pp. 715-718, 2009

·         Umit Aydin, Yesim Serinagaoglu, “Statistical modeling of the geometric error in cardiac electrical imaging,” IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), June 28-July 1, 2009, Boston, MA, USA

·         Umit Aydin, Yesim Serinagaoglu, “Imaging the electrical activity of the heart using a Kalman filter based approach: comparison of results using different STM's,” IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), June 28-July 1, 2009, Boston, MA, USA

·         Umit Aydin, Yesim Serinagaoglu, “Use of Activation Time Based Kalman Filtering in Inverse Problem of Electrocardiography,” 4th European Conference of the International Federation for Medical and Biological Engineering (23–27 November 2008 Antwerp, Belgium), IFMBE Proceedings, vol. 22, pp. 1200-1203.

·         Murat Onal, Yesim Serinagaoglu, “Spatio-Temporal Solutions in Inverse Electrocardiography,” 4th European Conference of the International Federation for Medical and Biological Engineering (23–27 November 2008 Antwerp, Belgium), IFMBE Proceedings, vol. 22, pp. 180-183.

·         M.Cavusoglu, M.Kamasak, O.Erogul, T.Ciloglu, Y.Serinagaoglu, T.Akcam, “Spectral Envelope Analysis of Snoring Signals”, 6th IASTED (The International Association of Science and Technology for Development) International Conference on Biomedical Engineering, February, 2008, Innsbruck, Austria

·         Mustafa Cavusoglu, Mustafa Kamasak, Osman Erogul, Tolga Ciloglu, Timur Akcam, Yesim Serinagaoglu, “SASA: A Software System for Sleep and Snoring Analsis,” International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, April 30-May 2, 2007, Antalya, Turkey.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks, and R.S. MacLeod, “A Bayesian Approach to Inclusion and Performance Analysis of Using Extra Information in Bioelectric Inverse Problems,” ICIP 2003, Sep. 14-17, Barcelona, Spain, 2003.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks, and R.S. MacLeod, “Prior Model Selection for Bayesian Inverse Electrocardiography,” NFSI 2003, Sep. 10-13, Chieti, Italy, 2003.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks, and R.S. MacLeod, “Combining Numerical and Physiological Constraints in Inverse Electrocardiography,” invited paper for 30th International Congress on Electrocardiology, June 11-14, Helsinki, Finland, 2003.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks, and R.S. MacLeod, “Enhancing inverse electrocardiography with sparse noisy measurements of epicardial potentials,” Paper for Int. Conf. on Bioelectromagnetism, 2002 and Int. Journal of Bioelectromagnetism, vol. 4, no. 2, pp. 89-90, 2002.

·         Y. Serinagaoglu, D.H. Brooks, and R.S. MacLeod, “Including sparse noisy epicardial potential measurements into Bayesian inverse electrocardiography,” invited paper in Int. Conf. of the EMBS, IEEE, Houston, TX, 2002.

·         R.S. MacLeod, B. Yilmaz, B. Taccardi, B. Punske, Y. Serinagaoglu and D.H. Brooks, “Direct and inverse methods for cardiac mapping using multielectrode catheter measurements,” Paper for NFSI 2001 and the J. Biomedizinische Technik, vol. 46(supp), pp. 207-208, 2001.

·         Y.Serinagaoglu, D.H. Brooks, S-F. Lin, T.J. Wu, “Bayesian Multiresolution MAP Estimation of Edge or Transition Point Location in Noisy Signals,” paper in conference proceedings CD of Int. Conf. on Acoustics, Sig. and Speech Proc., IEEE, Istanbul, Turkey, 2000.

·         Y. Serinagaoglu, D. Sabuncuoglu, Y.Z. Ider, “Spectral Analysis of T-Wave Alternans Signal,” paper in conference proceedings CD of Int. Conf. of EMBS, IEEE, Amsterdam, NL, 1996.

·         D. Sabuncuoglu, Y. Serinagaoglu, Y.Z. Ider, “Analysis of Heart Rate Variability during Standardized Exercise Testing,” paper in conference proceedings CD of Int. Conf. of EMBS, IEEE, Amsterdam, NL, 1996.

 

National Conferences:

·         S. Öz, Y. Serinağaoğlu Doğrusöz, “Havza Dönüşüm ve k-Means Kümeleme Algoritmaları Kullanarak Gövde BT Görüntüleri için Bölütleme Algoritma Uygulaması” 2. Tıp Teknolojileri Ulusal Kongresi – 16. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT 2011), 13-16 Ekim 2011, Antalya.

·         Ali Bircan, Yeşim Serinağaoğlu “Minimum Göreceli (Çapraz) Entropi (MGE) Metodunun Ters EKG Probleminin Çözümünde Uygulanması,” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 21-24 Nisan 2010, Antalya

·         Alireza Mazloumi Gavgani, Yeşim Serinağaoğlu Doğrusöz “Elektrokardiyografi Ters Problemi için Grafik Kullanıcı Arayüzü,” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 21-24 Nisan 2010, Antalya

·         Umit Aydin, Yesim Serinagaoglu “Ters Elektrokardiyografinin Zaman-Uzamsal Çözümünde Kalman Filtre ve Bayes-MAP Yöntemlerinin Karşılaştırılması,” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 21-24 Nisan 2010, Antalya

·         Sinan Oz, Yesim Serinagaoglu “Eşikleme Metodunu Kullanarak Medikal Görüntü Serisinden Hızlı 3 Boyutlu Model Oluşturma,” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 21-24 Nisan 2010, Antalya

·         Ceren Bora, Yeşim Serinağaoğlu, Ergin Tönük “Hücresel otomaton yöntemi ile elektromekanik kalp doku modeli,” 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 21-24 Nisan 2010, Antalya

·         Ümit Aydın, Yeşim Serinağaoğlu, “Ters EKG Probleminin Kalman Filtre ile Çözümünde Durum Geçiş Matrisinin Eğitici Kümeler Yardımı ile Kestirimi,” 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 20-24 Mayıs 2009, Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, İzmir

·         Ümit Aydın, Yeşim Serinağaoğlu, “Kalman Filtre ve BayesMAP ile Ters EKG Çözümlerinde Geometrik Hataların Etkisi,” 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 20-24 Mayıs 2009, Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, İzmir

·         Ümit Aydın, Yeşim Serinağaoğlu, “Geri elektrokardiyografi probleminde aktivasyon zamanına dayali Kalman filtreleme kullanımı,” 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 29-31 Mayıs 2008, ODTÜ, Ankara

·         Murat Önal, Yeşim Serinağaoğlu, “Geri elektrokardiografi probleminin zamansal-uzamsal düzenlileştirilmesi,” 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 29-31 Mayıs 2008, ODTÜ, Ankara

·         Eyüp Güler, Mustafa Çavuşoğlu, Mustafa Kamaşak, Yeşim Serinağaoğlu, Tolga Çiloğlu, Osman Eroğul “Tıkanmaya bağlı uyku apnesinin kestirimi için horlama seslerinin MDVP analizi,” 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 29-31 Mayıs 2008, ODTÜ, Ankara

·         M.Cavusoglu, M.Kamasak, O.Erogul, T.Ciloglu, Y.Serinagaoglu, H.Birkent “Tıkanmaya bağlı uyku apnesi hastaları ve basit horlayanlarda horlama seslerinin izgesel zarf incelemesi,” Sinyal Isleme ve Iletisim Uygulamalari Kurultayi (SİU), 11-13 Haziran 2007, Eskişehir

·         M. Çavuşoğlu, M. Kamasak, Y. Ertas, T. Ciloglu, Y. Serinagaoglu, O. Erogul, S.Yetkin “Horlama seslerinin uyku safhalarına göre şiddet ve sıklık analizi,” Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 22-23 Mayıs 2007, İstanbul

·         Mustafa Cavusoglu, Mustafa Kamasak, Yesim Serinagaoglu,Timur Akcam, Sinan Yetkin, Fuat Ozgen, Osman Erogul, “Robust Regression Algoritması ile Horlama Seslerinin Tespit Edilmesi ve Klinik Uygulaması,” 7. Ulusal Uyku Ve Bozuklukları Kongresi (Türk Uyku Araştırmaları Derneği), 25-29 Ekim 2006, Bodrum

·         Mustafa Cavusoglu, Mustafa Kamasak, Yesim Serinagaoglu, Timur Akcam, Osman Erogul, “Obstruktif Uyku Apnesi Hastaları İçin Horlama Seslerinin Spektogram Tabanlı Analizi,” Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 25-27 Mayıs 2006, İstanbul

·         Volkan Tanriverdi, Yeşim Serinağaoğlu, “Elektrokardiyografi Sinyalinden Eksen Kayması Gürültüsünün Kaldırılması,” Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT), 25-27 Mayıs 2006, İstanbul

·         Mustafa Cavusoglu, Yesim Serinagaoglu, Osman Erogul, “Obstruktif Uyku Apnesi (OSA) Hastaları İçin Horlama Seslerinin Analizi,” Sinyal Isleme ve Iletisim Uygulamalari Kurultayi (SİU), 17-19 Nisan 2006, Antalya

·         O. A. Demirkol, Y. Serinağaoğlu, “Gerçekçi Gövde Modelleri Oluşturulabilmesi İçin Bilgisayarlı Tomografi Görüntülerinin Bölütlenmesi,” BIYOMUT Bildiriler Kitabı, Istanbul, 2005.

·         Y. Serinağaoğlu,  D.H. Brooks, R.S. Macleod “Geri elektrokardiyografi probleminin Bayes yöntembilimi çerçevesinde değişik bilgi kaynaklari kullanilarak çözümü,” BIYOMUT Bildiriler Kitabı, Istanbul, 2003.

·         Y. Serinağaoğlu, D. Sabuncuoğlu, Y.Z. İder, “Spectral Analysis of T-Wave Alternans Signal,” Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı Bildiriler Kitabı, 1-3 Mayıs, Kuşadası, 1997.

·         D. Sabuncuoğlu, Y. Serinağaoğlu, Y.Z. İder, “Standart Egzersiz Testi Sırasında Kalp Hızı Değişiminin incelenmesi,” Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı Bildiriler Kitabı, 1-3 Mayıs, Kuşadası, 1997.